To substancje odżywiające korzystne bakterie jelitowe, które wspierają zdrowie układu pokarmowego i odpornościowego. Nie są one trawione przez organizm zwierzęcia, ale stanowią pożywkę dla „dobrych” bakterii, takich jak Lactobacillus czy Bifidobacterium, pomagając im się namnażać i utrzymywać równowagę mikroflory jelitowej.
W karmach dla psów i kotów prebiotyki występują m.in. w postaci FOS (fruktooligosacharydów), MOS (mannooligosacharydów) lub inuliny z cykorii. Ich regularne podawanie może poprawiać trawienie, ograniczać biegunki, wzdęcia i wahania apetytu, a także wzmacniać odporność.
Najlepsze efekty uzyskuje się, gdy prebiotyki występują w karmie razem z probiotykami, tworząc tzw. synbiotyk – kompleks wspierający zarówno rozwój, jak i aktywność pożytecznych bakterii w jelitach.